הסוגים העיקריים של ציוד הזיקוק כוללים את הדברים הבאים:
מזקק מולקולרי נופל: זוהי הצורה המוקדמת ביותר של ציוד זיקוק מולקולרי עם מבנה פשוט, אך לעיתים רחוקות הוא משמש כעת בגלל סרט הנוזל העבה ויעילות נמוכה .
מכשיר זיקוק מולקולרי מגרד סרט: הסרט הנוזל שנוצר על ידי מכשיר זה דק ויעילות ההפרדה גבוהה, אך המבנה מורכב יחסית . הוא שולט בעובי הסרט הנוזל על ידי הגדרת מגרד מסתובב, המתאים לייצור רציף והפרדה יעילה {}}
מכשיר זיקוק מולקולרי צנטריפוגלי: הוא משתמש בכוח צנטריפוגלי ליצירת סרט דק, בעל יעילות אידוי גבוהה והפרדה גבוהה, אך המבנה מורכב ועלות הייצור גבוהה {}} בדרך כלל היא דורשת שלבים מרובים בסדרה כדי להשיג הפרדה יעילה {}}
יתרונות וחסרונות של סוגים שונים של ציוד זיקוק:
נופל סרטים מולקולריים נופלים:
יתרונות: מבנה פשוט .
חסרונות: סרט נוזל עבה ויעילות נמוכה .
מכשיר זיקוק מולקולרי של סרטים:
יתרונות: סרט נוזלי דק ויעילות הפרדה גבוהה .
חסרונות: מבנה מורכב ומכשיר חלוקת נוזלים קשה למושלם .
Centrifugal מכשיר זיקוק מולקולרי :
Advantages: יעילות אידוי גבוהה .
Disadvantages: מבנה מורכב, עלות ייצור גבוהה, איטום ואקום קשה .

